bilgisayarci
FD Üye
Biyolojinin sunduğu bilgi birikimini bilgisayar teknolojilerinin tahlil teknikleri ile değerlendirmeyi sağlayan biyoinformatik ile biyolojik süreçlerin anlaşılabilirliğini artırmak hedefleniyor. Dr. Avcı, Bireye Özel Tıp hakkında bilgi verdi.
Biyoinformatiğin bilhassa hem hastalık yapan etkenlerin saptanmasında hem de bu hastalıkların tedavisinin bulunmasında bilim beşerlerine kolaylık sağladığını vurgulayan Dr. Öğr. Üyesi Fatma Gizem Avcı, bireye özel tıpta yepisyeni bir çağın başladığına dikkat çekiyor. Avcı, biyolojik soruların bilgisayar programları aracılığıyla çözülmesinin de biyoinformatik sayesinde mümkün hale geldiğini tabir ediyor.
Üsküdar Üniversitesi Mühendislik ve Tabiat Bilimleri Fakültesi Biyomühendislik İngilizce Kısım Lideri Dr. Öğr. Üyesi Fatma Gizem Avcı, disiplinler ortası bir bilim kolu olan biyoinformatikin sıhhat alanında sağladığı yararlardan bahsetti.
Talep sonucu süratle gelişti
Biyoloji ve enformatik sözlerinin birleşiminden oluşan biyoinformatiğin disiplinler ortası bir bilim kolu olduğunu belirten Dr. Öğr. Üyesi Fatma Gizem Avcı, “Biyoinformatik, biyolojinin sunduğu bilgi birikimini bilgisayar teknolojilerinin tahlil teknikleri ile değerlendirmeyi sağlıyor. Bilgisayarların moleküler biyolojide kullanımı, moleküler dizilimler ve üç boyutlu moleküler yapı data tabanlarının oluşturulması ile başladı. Kısa müddette çok yüksek ölçülerde data üreten, gen ekspresyonu, protein-protein bağlantısı, biyolojik olarak etkin molekül araştırmaları, bakteri, maya, hayvan ve insan genom projeleri üzere biyolojik deneylerin doğurduğu talep sonucunda bu alandaki bilişim uygulamaları süratle gelişti.” dedi.

Bilgi toplayıp tahlil etmeyi amaçlıyor
Biyoinformatiğin biyolojik bilgi ve bilgileri toplamak, depolamak, tahlil etmek ve yaymak için bilgisayar teknolojisini kullanmayı içeren bilimsel bir alt disiplin olduğunu tabir eden Dr. Öğr. Üyesi Fatma Gizem Avcı, “Biyoinformatiğin birincil maksadı biyolojik süreçlerin anlaşılabilirliğini artırmaktır. Bu gayeyle örüntü tanıma, data madenciliği, makine tahsili algoritmaları ve görselleştirme üzere farklı tekniklerden yararlanılıyor. Biyoinformatik araçları kullanılarak genom sekans bilgilerinin tahlili, ilaç tasarımı, ilaç keşfi (hedef belirleme, biyobelirteç tahmini), gen/protein yapısı ve işlevinin tahlili ve varsayımı, protein yapı hizalaması, gen varyasyonu ve ekspresyonunun tahlili, protein-protein etkileşimleri, gen düzenleme ağlarının iddiası ve tespiti, evrim modellemesi ve hücre bölünmesi/mitoz üzere çeşitli alanlarda araştırmalar yapılıyor.” diye konuştu.
Çok istikametli ve disiplinli yaklaşım gerektiriyor
Dr. Öğr. Üyesi Fatma Gizem Avcı, ‘Biyolojik çeşitliliği oluşturan canlı sistemleri, bu sistemlerin fonksiyonlarını, canlıları oluşturan biyomolekülleri, bu moleküllerin nasıl işlendiklerini ve genetik bilginin nasıl aktarıldığını araştıran moleküler biyoloji ve genetik çok istikametli ve çok disiplinli bir yaklaşımı gerektiriyor.’ dedi ve kelamlarını şöyle sürdürdü:
“Bilginin taşıyıcısı olan moleküllerin ve ömür için elzem olan moleküler yapıların ekseriyetle polimer yapıda olması son derece dikkat çekiyor. Diziler yahut sözler olarak yazılabilen bu tıp polimerler ve bağlı bahisler bilgisayarlar tarafından işlenebiliyor ve biyolojik dataların manalandırılması, saklanması ve görsel hale getirilmesi sağlanıyor. Böylelikle biyolojik soruların bilgisayar programları aracılığıyla çözülmesi biyoinformatik sayesinde mümkün hale geliyor. Biyoinformatik aracılığıyla biyolojik bilgi tabanlarında arama yapılarak hizalama ile dizilerin karşılaştırılmasını sağlanırken, protein yapılarının araştırılması ve filogenetik tahliller gerçekleştirilebiliyor.”

Kişiye özel tıpta yeni bir çağ başladı
Genetik bozuklukların incelenmesiyle ilgili çalışmaların tek gen araştırmalarından hücresel gen ağlarının keşfedilmesine, bunların karmaşık etkileşimlerinin anlaşılmasına ve hastalıktaki rollerinin belirlenmesine gerçek değiştiğini belirten Avcı, “Bunun bir sonucu olarak, bireye özel tıpta yepisyeni bir çağ başlamıştır. Biyoinformatik, araştırmacılara hesaplamalı biyolojinin getirdiği avantajlardan yararlanmaları için rehberlik ediyor ve yardımcı oluyor.” dedi.
Biyoinformatik bilim beşerlerine kolaylık sağlıyor
Gelişen teknoloji içerisinde bilginin dijital olarak işlenebildiği rastgele bir sistemin de biyoinformatiğin uygulama alanına girdiğini söz eden Dr. Öğr. Üyesi Fatma Gizem Avcı, “Böylece biyoinformatik tek bir hücreden bütün ekosistemlere kadar uygulanabiliyor. Bu sayede de biyoinformatik, bilhassa hem hastalık yapan etkenlerin saptanmasında hem de bu hastalıkların tedavisinin bulunmasında bilim beşerlerine kolaylık sağlıyor ve yeni teknolojilerin geliştirilmesine dayanak oluyor.” diye konuştu. (BSHA)