Ortognatik cerrahi ameliyatı tam donanımlı bir hastanede yapılır. Ameliyattan 1-3 gün sonra hasta taburcu edilir. Birinci günler hasta püre ya da çorba üzere yumuşak besinlerle beslenir. 15. gün çiğneme fonksiyonu başlar. Hastanın olağan günlük fonksiyonlarına kavuşması yaklaşık olarak 3-4 haftayı bulabilir. Ameliyattan sonra ortodontik tedavi devam eder ve 6 ay kadar sonra teller sökülerek tedavi bitirilir.
Ortognatik cerrahi tedavisinin estetik olduğu kadar fonksiyonel yararları da vardır. Çenelerin çok konumlarda durmaları, konuşma ve çiğneme fonksiyonlarının düzgün yapılamamasına, binaenaleyh çene eklemi rahatsızlıklarından sindirim sistemi dertlerine kadar pek çok illete sebep olabilir. Bu tedavi sayesinde dolaylı rahatsızlıkların da ortaya çıkması önlenmiş olur.
Ortognatik cerrahi tedavisi, ortodonti mütehassısı ve maksillofasiyal cerrahın kadro çalışması yapmasını gerektiren multidisipliner bir tedavidir. Bu tedavi sırasında ortodonti eksperi, hastasını yüz boyutları, diş fonksiyonları, okluzyon üzere pek çok kriteri göz önünde bulundurarak kıymetlendirir ve tedavi planlamasını yapar. Bu aşamada cerrah ile muhabereye geçilerek yapılan tedavi planının uygulanmasını doğrular. Bu tedavideki en değerli nokta, gerçekçi bir tedavi planlaması yapılması, ortodonti bilirkişisinin ve cerrahın tedavi gayesi açısından tıpkı fikirde olmasıdır.